在厂房维修翻新工程中，由于各种原因，可能会与施工单位发生纠纷。以下是一些处理与施工单位在厂房维修翻新工程中纠纷的建议：

1、保持冷静和理智。在发生纠纷时，不要过于激动或情绪化，要保持冷静和理智，避免做出过激的行动或决定。

2、了解纠纷原因和责任方。要了解纠纷的原因和责任方，如果是自己的责任，要勇于承担并积极解决；如果是施工单位的责任，要提供证据并合理要求其承担责任。

3、协商解决。在处理纠纷时，可以先尝试与施工单位进行协商解决。可以邀请中立的第三方（如监理单位、律师等）参与协商，以寻求公正、合理的解决方案。

4、寻求法律援助。如果协商无法解决纠纷，可以寻求法律援助。咨询专业律师，了解相关法律法规和程序，通过法律途径维护自己的权益。

5、保留证据。在处理纠纷过程中，要注意保留相关证据，如合同、施工图纸、现场照片、验收记录等。这些证据可以作为解决纠纷的重要依据。

6、避免拖延。处理纠纷时，要避免拖延时间，尽快采取行动解决。如果长期拖延，可能会使问题更加复杂，增加解决难度。

7、坚持原则。在处理纠纷时，要坚持原则，不轻易妥协或让步。同时，也要尊重施工单位的合理意见和建议，寻求双方都能接受的解决方案。

总之，处理与施工单位在厂房维修翻新工程中的纠纷需要保持冷静和理智，了解纠纷原因和责任方，协商解决或寻求法律援助，保留证据并坚持原则。通过合理的沟通和协商，大多数纠纷都可以得到妥善解决。